27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09430 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_09430  Protein of unknown function (DUF552)  100 
 
 
305 aa  615  1e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00133111  normal  0.107393 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2083  protein of unknown function DUF552  36.31 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.009742  hitchhiker  0.00000000000013242 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08920  hypothetical protein  47.73 
 
 
225 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.235686  hitchhiker  0.0000000335802 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0492  protein of unknown function DUF552  39.02 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.042492  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1486  hypothetical protein  33.72 
 
 
186 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3522  protein of unknown function DUF552  34.88 
 
 
197 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2994  hypothetical protein  29.71 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0342705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27340  hypothetical protein  29.63 
 
 
210 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3011  protein of unknown function DUF552  31.43 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1083  protein of unknown function DUF552  31.65 
 
 
151 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364899  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3321  hypothetical protein  35.21 
 
 
126 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5757  protein of unknown function DUF552  27.91 
 
 
215 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12177  hypothetical protein  30.99 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.899747  normal  0.644491 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1238  protein of unknown function DUF552  26.32 
 
 
179 aa  47  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.342775  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1200  cell division protein  27.66 
 
 
144 aa  47  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8946  hypothetical protein  32.86 
 
 
130 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1316  protein of unknown function DUF552  28.57 
 
 
167 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000581957  normal  0.957732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3261  hypothetical protein  31.43 
 
 
220 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289859  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3517  hypothetical protein  27.86 
 
 
210 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0721193  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3312  hypothetical protein  31.43 
 
 
220 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3318  protein of unknown function DUF552  36.36 
 
 
152 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000684072  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3250  hypothetical protein  31.43 
 
 
220 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0954  hypothetical protein  28.99 
 
 
142 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000182129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1891  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014941  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2640  protein of unknown function DUF552  28.77 
 
 
222 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.340811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1035  protein of unknown function DUF552  31.51 
 
 
144 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000196256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3256  protein of unknown function DUF552  24.71 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>