54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2083 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2083  protein of unknown function DUF552  100 
 
 
315 aa  629  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.009742  hitchhiker  0.00000000000013242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09430  Protein of unknown function (DUF552)  36.97 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00133111  normal  0.107393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08920  hypothetical protein  53.41 
 
 
225 aa  102  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.235686  hitchhiker  0.0000000335802 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0492  protein of unknown function DUF552  43.9 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.042492  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3011  protein of unknown function DUF552  35.21 
 
 
255 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1486  hypothetical protein  33.72 
 
 
186 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27340  hypothetical protein  37.33 
 
 
210 aa  56.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3522  protein of unknown function DUF552  33.72 
 
 
197 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5757  protein of unknown function DUF552  37.88 
 
 
215 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2640  protein of unknown function DUF552  32.88 
 
 
222 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.340811  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3256  protein of unknown function DUF552  34.85 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12177  hypothetical protein  35.21 
 
 
241 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.899747  normal  0.644491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2994  hypothetical protein  35.21 
 
 
224 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0342705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3261  hypothetical protein  35.21 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289859  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2921  protein of unknown function DUF552  33.33 
 
 
177 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00244461  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3517  hypothetical protein  35.21 
 
 
210 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0721193  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3312  hypothetical protein  35.21 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3250  hypothetical protein  35.21 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1600  protein of unknown function DUF552  33.82 
 
 
164 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1289  protein of unknown function DUF552  33.82 
 
 
162 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.187686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1412  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102677 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16510  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809047  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2405  protein of unknown function DUF552  32.35 
 
 
162 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.251598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1079  protein of unknown function DUF552  33.33 
 
 
160 aa  49.7  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208009  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1083  protein of unknown function DUF552  36.11 
 
 
151 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364899  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1116  hypothetical protein  32.14 
 
 
210 aa  49.7  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22750  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.515425  normal  0.0364691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5091  hypothetical protein  29.76 
 
 
192 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153174  hitchhiker  0.00267894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3193  protein of unknown function DUF552  31.82 
 
 
187 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.749912  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0457  cell division family protein  34.62 
 
 
152 aa  48.9  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0954  hypothetical protein  29.33 
 
 
142 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000182129  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1421  hypothetical protein  29.03 
 
 
187 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00683826  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2876  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17566  normal  0.55064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0903  protein of unknown function DUF552  33.33 
 
 
172 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10359  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1024  hypothetical protein  32.56 
 
 
175 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.695466  hitchhiker  0.00825865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1577  protein of unknown function DUF552  30.88 
 
 
176 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110571 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10860  hypothetical protein  31.71 
 
 
162 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0170593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1576  hypothetical protein  30.88 
 
 
178 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135091  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3318  protein of unknown function DUF552  31.82 
 
 
152 aa  46.2  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000684072  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3796  protein of unknown function DUF552  33.82 
 
 
202 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.423363  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0137  hypothetical protein  34.85 
 
 
159 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0371341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3057  hypothetical protein  28.79 
 
 
165 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6101  protein of unknown function DUF552  31.88 
 
 
203 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608193  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1345  protein of unknown function DUF552  31.46 
 
 
145 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3208  hypothetical protein  25.68 
 
 
229 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4006  hypothetical protein  28.38 
 
 
193 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0827549  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1316  protein of unknown function DUF552  28 
 
 
167 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000581957  normal  0.957732 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1238  protein of unknown function DUF552  27.78 
 
 
179 aa  43.9  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.342775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3434  hypothetical protein  26.87 
 
 
226 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447555  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1891  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  42.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014941  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13540  hypothetical protein  25.37 
 
 
210 aa  42.7  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270166  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04471  hypothetical protein  26.21 
 
 
191 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.811311  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2060  cell division protein  25.93 
 
 
196 aa  42.7  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1730  hypothetical protein  26.21 
 
 
191 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>