41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2448 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2448  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
124 aa  259  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1046  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.32 
 
 
129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.852357  normal  0.698393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01829  Glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  64.52 
 
 
126 aa  176  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2955  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.9 
 
 
126 aa  175  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0089  glyoxalase family protein  63.36 
 
 
136 aa  174  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0993  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  61.29 
 
 
128 aa  169  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0935  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.61 
 
 
138 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00088533  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2788  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  54.84 
 
 
127 aa  146  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2905  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.64 
 
 
129 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0192  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.58 
 
 
126 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.150042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0962  phosphomethylpyrimidine kinase  49.59 
 
 
382 aa  120  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.547391  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2553  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.97 
 
 
129 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538213  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1860  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.36 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2210  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122123  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1761  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.55 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000756575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2005  hypothetical protein  32.71 
 
 
267 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23670  hypothetical protein  31.78 
 
 
267 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0174073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3173  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.69 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2345  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.325941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7718  putative lyase  26.15 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3171  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 
136 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000424368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.81 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2482  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.57 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0109  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.08 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1693  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
194 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.984536  normal  0.249305 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0214  glyoxalase family protein  29.07 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.018554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.55 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00159015  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1285  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.19 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  hitchhiker  0.00110448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0010  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.19 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0624  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.0374079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.29 
 
 
135 aa  42  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.94151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0490  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
138 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.653023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.09 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17360  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  26.02 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1734  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.824084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3136  glutathione transferase  28.57 
 
 
113 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1554  glyoxalase family protein  28.7 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2424  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.22 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0566516  hitchhiker  0.00174079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3007  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.22 
 
 
136 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.862449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  41.86 
 
 
144 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>