18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0993 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0993  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  100 
 
 		 128 aa  272  9e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1046  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.72 
 
 		 129 aa  189  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.852357  normal  0.698393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2955  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.4 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2448  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.29 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01829  Glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  60 
 
 		 126 aa  167  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0089  glyoxalase family protein  58.52 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0935  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.2 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00088533  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2788  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  56.8 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2905  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.54 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2553  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.44 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0192  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.74 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.150042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0962  phosphomethylpyrimidine kinase  43.44 
 
 		 382 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.547391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2005  hypothetical protein  33.03 
 
 		 267 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23670  hypothetical protein  33.03 
 
 		 267 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0174073 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0214  glyoxalase family protein  27.36 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.018554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1761  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 		 143 aa  43.5  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000756575  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2482  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.95 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0188  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 		 264 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>