26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2788 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2788  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  100 
 
 		 127 aa  264  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2955  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.4 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0089  glyoxalase family protein  55.64 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01829  Glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  56 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2448  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.84 
 
 		 124 aa  146  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0935  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.49 
 
 		 138 aa  144  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00088533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1046  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.76 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.852357  normal  0.698393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0993  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  56.8 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2553  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.6 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2905  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.54 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0192  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.58 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.150042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0962  phosphomethylpyrimidine kinase  49.18 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.547391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2687  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.89 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.967274  normal  0.218251 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0631  hypothetical protein  30.56 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.29 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.29 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0381  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.44 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0071702  normal  0.210559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17360  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  29.84 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1734  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2807  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1554  glyoxalase family protein  29.25 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2176  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.42 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0080  hypothetical protein  30.19 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.038673  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2411  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000243235  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4115  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.726445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.45 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2005  hypothetical protein  28.97 
 
 		 267 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>