58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2687 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2687  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
131 aa  269  9e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.967274  normal  0.218251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2897  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  76.34 
 
 
148 aa  206  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5397  hypothetical protein  57.36 
 
 
153 aa  150  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15934  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3492  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.56 
 
 
133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.81151  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.49 
 
 
174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0469  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.08 
 
 
145 aa  130  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17360  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  53.85 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1734  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4085  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.78 
 
 
126 aa  121  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0088238  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3317  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.29 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.688125  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2681  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.11 
 
 
121 aa  110  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000007341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5329  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.91 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1109  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.38 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2493  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.88 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000450738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5734  hypothetical protein  34.17 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0632882  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4303  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.76 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.477386 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3856  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207076  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24051  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2591  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3001  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 
139 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2051  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.4 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.622827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0631  hypothetical protein  31.03 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2762  hypothetical protein  34.43 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4066  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.32661 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3175  hypothetical protein  30.83 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.798678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.129026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0328  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.77 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.12 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.697141  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0978  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.9 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00125904  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4432  lactoylglutathione lyase  28.33 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6552  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.33 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2192  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.01 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0194216  hitchhiker  0.00758205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1470  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.22177 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1686  hypothetical protein  29.03 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3203  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.397338 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3933  hypothetical protein  31.09 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00670375  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3141  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2788  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  30.89 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
211 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2842  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.17 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2755  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.222577  normal  0.0220403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.28 
 
 
136 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.43 
 
 
137 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1430  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.45 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363294  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5403  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3749  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 
214 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127226  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1871  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3047  glyoxalase family protein  25.6 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144066  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3393  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.1 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000263395  hitchhiker  0.00355906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0562  glyoxalase  32.1 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69093  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5993  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.33 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337391  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3883  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777877  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4393  glyoxalase/bleomycin resistance protein dioxygenase superfamily protein  25.83 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3046  glyoxalase family protein  25.6 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1372  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.715832  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0183  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.42 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0312  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 
123 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4186  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 
145 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>