23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1941 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1941  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.305518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1792  hypothetical protein  50.88 
 
 		 286 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.974933  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4503  hypothetical protein  52.79 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2217  hypothetical protein  52.79 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000011736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2230  hypothetical protein  52.42 
 
 		 299 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00147411  normal  0.0163306 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1807  hypothetical protein  49.26 
 
 		 289 aa  285  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00067407  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2001  hypothetical protein  52.36 
 
 		 268 aa  285  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424573  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2204  hypothetical protein  51.3 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000217456  normal  0.223194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2154  hypothetical protein  51.67 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000926677  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2105  hypothetical protein  46.47 
 
 		 277 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2227  hypothetical protein  45.72 
 
 		 276 aa  269  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2022  hypothetical protein  48.73 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  hitchhiker  0.00000213318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1953  hypothetical protein  48.36 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000171054  hitchhiker  0.00261274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2123  hypothetical protein  48.36 
 
 		 295 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000221039  normal  0.0151764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2346  hypothetical protein  48.33 
 
 		 292 aa  265  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2394  hypothetical protein  44.2 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.265059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1890  hypothetical protein  48.43 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00358121  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1639  hypothetical protein  34.93 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2343  putative lipoprotein  25.97 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01257  hypothetical protein  28.22 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1583  putative lipoprotein  26.24 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000549733  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03047  hypothetical protein  23.58 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002910  hypothetical protein  21.68 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000567141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>