24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2022 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2022  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  hitchhiker  0.00000213318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2123  hypothetical protein  99.32 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000221039  normal  0.0151764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1953  hypothetical protein  95.61 
 
 		 295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000171054  hitchhiker  0.00261274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2346  hypothetical protein  84.98 
 
 		 292 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2230  hypothetical protein  79.86 
 
 		 299 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00147411  normal  0.0163306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2204  hypothetical protein  79.39 
 
 		 299 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000217456  normal  0.223194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2217  hypothetical protein  80.2 
 
 		 299 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000011736  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4503  hypothetical protein  80.2 
 
 		 299 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2154  hypothetical protein  79.52 
 
 		 299 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000926677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1890  hypothetical protein  79.06 
 
 		 281 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00358121  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1807  hypothetical protein  49.81 
 
 		 289 aa  275  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00067407  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2394  hypothetical protein  47.97 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.265059 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1941  hypothetical protein  48.73 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.305518  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2227  hypothetical protein  50.19 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2001  hypothetical protein  48.82 
 
 		 268 aa  265  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424573  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1792  hypothetical protein  46.72 
 
 		 286 aa  255  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.974933  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2105  hypothetical protein  47.21 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1639  hypothetical protein  32.24 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2343  putative lipoprotein  28.35 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01257  hypothetical protein  32.26 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1583  putative lipoprotein  27.09 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000549733  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03047  hypothetical protein  29.17 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002910  hypothetical protein  25.78 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000567141  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1851  hypothetical protein  28.17 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>