24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2227 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2227  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2394  hypothetical protein  66.54 
 
 		 278 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.265059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2001  hypothetical protein  62.84 
 
 		 268 aa  364  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424573  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2105  hypothetical protein  52.21 
 
 		 277 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1807  hypothetical protein  53.58 
 
 		 289 aa  308  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00067407  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1890  hypothetical protein  51.94 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00358121  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1792  hypothetical protein  48.42 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.974933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2346  hypothetical protein  50.58 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1953  hypothetical protein  48.52 
 
 		 295 aa  271  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000171054  hitchhiker  0.00261274 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2230  hypothetical protein  48.87 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00147411  normal  0.0163306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2123  hypothetical protein  50.56 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000221039  normal  0.0151764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1941  hypothetical protein  45.72 
 
 		 276 aa  269  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.305518  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4503  hypothetical protein  48.5 
 
 		 299 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2217  hypothetical protein  48.5 
 
 		 299 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000011736  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2022  hypothetical protein  50.19 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  hitchhiker  0.00000213318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2154  hypothetical protein  47.74 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000926677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2204  hypothetical protein  47.37 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000217456  normal  0.223194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1639  hypothetical protein  34.07 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01257  hypothetical protein  26.87 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1583  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000549733  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03047  hypothetical protein  26.15 
 
 		 273 aa  89  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002910  hypothetical protein  26.98 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000567141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2343  putative lipoprotein  24.9 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1851  hypothetical protein  24.42 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>