24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2346 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2346  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1953  hypothetical protein  85.96 
 
 
295 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000171054  hitchhiker  0.00261274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2123  hypothetical protein  84.93 
 
 
295 aa  521  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000221039  normal  0.0151764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2022  hypothetical protein  84.98 
 
 
296 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  hitchhiker  0.00000213318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2204  hypothetical protein  80 
 
 
299 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000217456  normal  0.223194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2217  hypothetical protein  79.32 
 
 
299 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000011736  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4503  hypothetical protein  79.32 
 
 
299 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2230  hypothetical protein  79.32 
 
 
299 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00147411  normal  0.0163306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2154  hypothetical protein  79.66 
 
 
299 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000926677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1890  hypothetical protein  76.7 
 
 
281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00358121  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1807  hypothetical protein  47.75 
 
 
289 aa  285  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00067407  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2394  hypothetical protein  47.84 
 
 
278 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.265059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2001  hypothetical protein  50.58 
 
 
268 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424573  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2227  hypothetical protein  50.58 
 
 
276 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180975  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1941  hypothetical protein  48.33 
 
 
276 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.305518  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2105  hypothetical protein  48.3 
 
 
277 aa  257  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1792  hypothetical protein  45.49 
 
 
286 aa  254  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.974933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1639  hypothetical protein  28.33 
 
 
261 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2343  putative lipoprotein  27.41 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01257  hypothetical protein  29.32 
 
 
286 aa  92.4  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1583  putative lipoprotein  23.92 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000549733  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002910  hypothetical protein  23.74 
 
 
273 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000567141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03047  hypothetical protein  27.18 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1851  hypothetical protein  29.17 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>