45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1519 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1519  curli production assembly/transport component CsgF precursor  100 
 
 		 133 aa  265  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817654  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1819  curli production assembly/transport component CsgF precursor  77.27 
 
 		 135 aa  204  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0321037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1728  curli production assembly/transport component CsgF precursor  73.68 
 
 		 139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2464  curli production assembly/transport component CsgF precursor  47.06 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3473  curli fiber protein CsgF, putative  48.25 
 
 		 137 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.910163  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2298  hypothetical protein  48.25 
 
 		 137 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2473  curli production assembly/transport component CsgF precursor  47.37 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.308509 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2856  assembly/transport component in curli production, CsgF precursor  47.24 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.618254  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1992  curli fiber protein CsgF, putative  46.96 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0290148  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0642  curli production assembly/transport component CsgF, putative  40.8 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00175392  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0869  curli production assembly/transport component CsgF, putative  36.59 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3153  curli production assembly/transport component CsgF, putative  36.59 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3254  curli production assembly/transport component CsgF, putative  36.59 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2858  curli production assembly/transport component CsgF, putative  41.12 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0970  curli production assembly/transport component CsgF, putative  38.21 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3686  curli production assembly/transport component CsgF, putative  36.59 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2985  curli production assembly/transport component CsgF, putative  38.32 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01505  putative curli production assembly/transport component  34.46 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3335  curli production assembly/transport component CsgF, putative  38.05 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1025  curli production assembly/transport component CsgF, putative  38.05 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1004  curli production assembly/transport component CsgF, putative  38.05 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1037  curli production assembly/transport component CsgF, putative  38.05 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.730845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1251  curli assembly protein CsgF  34.69 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1206  curli assembly protein CsgF  34.69 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.388292  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1236  curli assembly protein CsgF  34.69 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.788328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2050  curli assembly protein CsgF  34.69 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360052  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2233  curli assembly protein CsgF  34.69 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.697441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1417  curli assembly protein CsgF  31.63 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0483844 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01042  hypothetical protein  31.63 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2607  curli assembly protein CsgF  31.63 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2095  curli assembly protein CsgF  31.63 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771182 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2561  curli assembly protein CsgF  31.63 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.368345 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1157  curli assembly protein CsgF  31.63 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1156  curli assembly protein CsgF  31.63 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.572292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1554  curli assembly protein CsgF  32.26 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.381005  normal  0.199683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01035  predicted transport protein  31.63 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.868652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2291  curli assembly protein CsgF  30.61 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2350  hypothetical protein  32.03 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4729  Curli production assembly/transport component CsgF  31.82 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6062  Curli production assembly/transport component CsgF  29.55 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2587  hypothetical protein  36.67 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2414  hypothetical protein  60 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1275  hypothetical protein  44.44 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0031  hypothetical protein  33.06 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2731  hypothetical protein  45.16 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>