31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0970 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0970  curli production assembly/transport component CsgF, putative  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3254  curli production assembly/transport component CsgF, putative  76.38 
 
 		 131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3153  curli production assembly/transport component CsgF, putative  76.38 
 
 		 131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0869  curli production assembly/transport component CsgF, putative  75.59 
 
 		 131 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3686  curli production assembly/transport component CsgF, putative  74.8 
 
 		 131 aa  191  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1004  curli production assembly/transport component CsgF, putative  74.8 
 
 		 131 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1037  curli production assembly/transport component CsgF, putative  74.8 
 
 		 131 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.730845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3335  curli production assembly/transport component CsgF, putative  74.8 
 
 		 131 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1025  curli production assembly/transport component CsgF, putative  74.8 
 
 		 131 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2985  curli production assembly/transport component CsgF, putative  71.65 
 
 		 131 aa  184  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0642  curli production assembly/transport component CsgF, putative  70.31 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00175392  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2858  curli production assembly/transport component CsgF, putative  68.75 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01505  putative curli production assembly/transport component  43.62 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2473  curli production assembly/transport component CsgF precursor  37.01 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.308509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2464  curli production assembly/transport component CsgF precursor  36.57 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1728  curli production assembly/transport component CsgF precursor  38.64 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2298  hypothetical protein  38.6 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3473  curli fiber protein CsgF, putative  38.6 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.910163  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1519  curli production assembly/transport component CsgF precursor  38.71 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817654  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1819  curli production assembly/transport component CsgF precursor  39.32 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0321037  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1992  curli fiber protein CsgF, putative  39.34 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0290148  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2350  hypothetical protein  33.08 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6062  Curli production assembly/transport component CsgF  29.86 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2856  assembly/transport component in curli production, CsgF precursor  33.33 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.618254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4729  Curli production assembly/transport component CsgF  31.85 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2587  hypothetical protein  32 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2731  hypothetical protein  34.68 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1275  hypothetical protein  36.26 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2414  hypothetical protein  34.65 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0031  hypothetical protein  34.18 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3753  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>