19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1448 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1448  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000358509  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2411  hypothetical protein  70.5 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2395  hypothetical protein  68.09 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000053326  normal  0.472241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2917  hypothetical protein  68.7 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1703  hypothetical protein  62.68 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000496418  normal  0.011388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2383  hypothetical protein  67.18 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000246073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1493  hypothetical protein  60 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1689  hypothetical protein  64.12 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000207896  hitchhiker  0.00865349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2676  hypothetical protein  64.12 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000906467  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2695  hypothetical protein  64.12 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000059883  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2774  hypothetical protein  64.12 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000243712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1548  hypothetical protein  64.89 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000222885  normal  0.0948256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1489  hypothetical protein  64.89 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000234545  normal  0.878766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1554  hypothetical protein  64.12 
 
 		 144 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1667  hypothetical protein  56.67 
 
 		 154 aa  177  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2888  hypothetical protein  69.75 
 
 		 131 aa  176  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  decreased coverage  0.00000058531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2250  putative lipoprotein  26.06 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02169  putative lipoprotein  26.95 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2518  putative lipoprotein  27.4 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>