19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2518 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2518  putative lipoprotein  100 
 
 		 150 aa  311  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02169  putative lipoprotein  40.44 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2250  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2395  hypothetical protein  29.25 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000053326  normal  0.472241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1493  hypothetical protein  27.86 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1703  hypothetical protein  26.9 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000496418  normal  0.011388 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1448  hypothetical protein  27.4 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000358509  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2383  hypothetical protein  28.46 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000246073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2411  hypothetical protein  24.29 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2917  hypothetical protein  28.83 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1667  hypothetical protein  24.16 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2888  hypothetical protein  30.36 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  decreased coverage  0.00000058531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1689  hypothetical protein  27.93 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000207896  hitchhiker  0.00865349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2774  hypothetical protein  27.93 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000243712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2695  hypothetical protein  27.93 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000059883  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2676  hypothetical protein  27.93 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000906467  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1548  hypothetical protein  27.27 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000222885  normal  0.0948256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1489  hypothetical protein  27.27 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000234545  normal  0.878766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1554  hypothetical protein  27.2 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.148457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>