19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2250 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2250  putative lipoprotein  100 
 
 		 148 aa  306  8e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02169  putative lipoprotein  29.58 
 
 		 152 aa  96.7  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2518  putative lipoprotein  34.72 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1448  hypothetical protein  25.53 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000358509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2888  hypothetical protein  27.78 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  decreased coverage  0.00000058531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2395  hypothetical protein  25.74 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000053326  normal  0.472241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1703  hypothetical protein  25.19 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000496418  normal  0.011388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1667  hypothetical protein  25.55 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1493  hypothetical protein  22.63 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2411  hypothetical protein  25.98 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2917  hypothetical protein  26.19 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1489  hypothetical protein  27.5 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000234545  normal  0.878766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1554  hypothetical protein  27.5 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1548  hypothetical protein  27.5 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000222885  normal  0.0948256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2383  hypothetical protein  26.98 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000246073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1689  hypothetical protein  23.58 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000207896  hitchhiker  0.00865349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2774  hypothetical protein  23.33 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000243712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2695  hypothetical protein  23.33 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000059883  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2676  hypothetical protein  23.33 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000906467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>