18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2275 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2275  bacteriophage Lambda NinG protein  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.148456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1131  bacteriophage Lambda NinG protein  99.51 
 
 
203 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.892227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2827  bacteriophage Lambda NinG protein  99.51 
 
 
203 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.866172  normal  0.519662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1093  bacteriophage Lambda NinG protein  98.03 
 
 
203 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1061  bacteriophage Lambda NinG protein  99.01 
 
 
203 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  hitchhiker  0.00000642825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2912  bacteriophage Lambda NinG protein  45.45 
 
 
201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000145708  hitchhiker  0.00000000000507965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0885  bacteriophage Lambda NinG protein  43.78 
 
 
207 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3541  bacteriophage Lambda NinG protein  44.44 
 
 
201 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.071423  hitchhiker  0.0000000583568 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3885  bacteriophage Lambda NinG protein  41.21 
 
 
203 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2806  bacteriophage lambda NinG  35.86 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.08856  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3429  lambda NinG family protein  35.41 
 
 
201 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0894801  unclonable  8.56403e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3229  lambda NinG family protein  38.19 
 
 
198 aa  98.6  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.65785  hitchhiker  0.00866577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3389  bacteriophage lambda NinG family protein  33.49 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320142  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1939  lambda NinG family protein  37.66 
 
 
191 aa  88.6  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0633866  hitchhiker  0.000032667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4102  lambda NinG family protein  37.66 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000261218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1024  bacteriophage lambda NinG family protein  33.18 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1396  gifsy-1 prophage NinG  65.71 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.117116  hitchhiker  0.0000000000156857 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1394  NinG recombination protein  42.57 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000538638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>