18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3389 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_3389  bacteriophage lambda NinG family protein  100 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320142  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3429  lambda NinG family protein  94.44 
 
 
201 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0894801  unclonable  8.56403e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2806  bacteriophage lambda NinG  48.74 
 
 
194 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.08856  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2912  bacteriophage Lambda NinG protein  40.3 
 
 
201 aa  148  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000145708  hitchhiker  0.00000000000507965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3541  bacteriophage Lambda NinG protein  39.3 
 
 
201 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.071423  hitchhiker  0.0000000583568 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0885  bacteriophage Lambda NinG protein  38.61 
 
 
207 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1394  NinG recombination protein  40 
 
 
203 aa  141  6e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000538638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3885  bacteriophage Lambda NinG protein  38.54 
 
 
203 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1024  bacteriophage lambda NinG family protein  36.76 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3229  lambda NinG family protein  49.28 
 
 
198 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.65785  hitchhiker  0.00866577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4102  lambda NinG family protein  35.85 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000261218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2275  bacteriophage Lambda NinG protein  34.69 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.148456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2827  bacteriophage Lambda NinG protein  35.64 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.866172  normal  0.519662 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1131  bacteriophage Lambda NinG protein  35.64 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.892227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1939  lambda NinG family protein  35.85 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0633866  hitchhiker  0.000032667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1093  bacteriophage Lambda NinG protein  33.82 
 
 
203 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1061  bacteriophage Lambda NinG protein  35.11 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  hitchhiker  0.00000642825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0388  gp69  54.76 
 
 
50 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000215347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>