18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1093 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1093  bacteriophage Lambda NinG protein  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2275  bacteriophage Lambda NinG protein  98.03 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.148456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1131  bacteriophage Lambda NinG protein  98.52 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.892227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1061  bacteriophage Lambda NinG protein  98.03 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  hitchhiker  0.00000642825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2827  bacteriophage Lambda NinG protein  97.54 
 
 		 203 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.866172  normal  0.519662 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2912  bacteriophage Lambda NinG protein  44.95 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000145708  hitchhiker  0.00000000000507965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0885  bacteriophage Lambda NinG protein  43.28 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3541  bacteriophage Lambda NinG protein  43.94 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.071423  hitchhiker  0.0000000583568 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3885  bacteriophage Lambda NinG protein  40.7 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2806  bacteriophage lambda NinG  35.35 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.08856  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3229  lambda NinG family protein  37.56 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.65785  hitchhiker  0.00866577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3429  lambda NinG family protein  33.97 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0894801  unclonable  8.56403e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3389  bacteriophage lambda NinG family protein  33.82 
 
 		 200 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1939  lambda NinG family protein  37.01 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0633866  hitchhiker  0.000032667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4102  lambda NinG family protein  37.01 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000261218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1024  bacteriophage lambda NinG family protein  33.18 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1394  NinG recombination protein  41.58 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000538638  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1396  gifsy-1 prophage NinG  62.86 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.117116  hitchhiker  0.0000000000156857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>