18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3541 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3541  bacteriophage Lambda NinG protein  100 
 
 
201 aa  413  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.071423  hitchhiker  0.0000000583568 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2912  bacteriophage Lambda NinG protein  95.52 
 
 
201 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000145708  hitchhiker  0.00000000000507965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0885  bacteriophage Lambda NinG protein  84.95 
 
 
207 aa  334  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3885  bacteriophage Lambda NinG protein  82.91 
 
 
203 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2275  bacteriophage Lambda NinG protein  46.24 
 
 
205 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.148456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2827  bacteriophage Lambda NinG protein  46.24 
 
 
203 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.866172  normal  0.519662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1093  bacteriophage Lambda NinG protein  43.94 
 
 
203 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172761 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1131  bacteriophage Lambda NinG protein  46.24 
 
 
203 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.892227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1061  bacteriophage Lambda NinG protein  45.7 
 
 
203 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  hitchhiker  0.00000642825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3429  lambda NinG family protein  40.98 
 
 
201 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0894801  unclonable  8.56403e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3389  bacteriophage lambda NinG family protein  41.29 
 
 
200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320142  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1024  bacteriophage lambda NinG family protein  38.57 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1394  NinG recombination protein  40.91 
 
 
203 aa  142  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000538638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2806  bacteriophage lambda NinG  41.89 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.08856  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3229  lambda NinG family protein  44.53 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.65785  hitchhiker  0.00866577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1939  lambda NinG family protein  35.71 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0633866  hitchhiker  0.000032667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4102  lambda NinG family protein  35.06 
 
 
191 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000261218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0388  gp69  81.63 
 
 
50 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000215347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>