23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1659 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1659  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  226  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1663  hypothetical protein  94.55 
 
 
170 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1723  hypothetical protein  92.73 
 
 
110 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.034486  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1616  hypothetical protein  94.37 
 
 
71 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.396977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1790  hypothetical protein  93.55 
 
 
62 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2434  hypothetical protein  59.63 
 
 
108 aa  120  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2336  hypothetical protein  55.96 
 
 
108 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110773  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2346  hypothetical protein  53.21 
 
 
108 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000082368  hitchhiker  0.00160333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2233  hypothetical protein  53.21 
 
 
108 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0210467  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2114  putative cytoplasmic protein  53.21 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000392621  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2169  putative cytoplasmic protein  53.21 
 
 
108 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000813161  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2748  hypothetical protein  43.93 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0940  protein of unknown function DUF1493  29.66 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.255022  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5116  hypothetical protein  30.91 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221736  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4587  hypothetical protein  37.97 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4583  hypothetical protein  30.91 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2476  hypothetical protein  27.78 
 
 
125 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5682  hypothetical protein  31.03 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2848  hypothetical protein  33.02 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0835  hypothetical protein  29.7 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0109  hypothetical protein  29.7 
 
 
141 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0666  hypothetical protein  25.23 
 
 
124 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131147  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0239  protein of unknown function DUF1493  35.38 
 
 
71 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>