19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2336 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2336  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110773  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2114  putative cytoplasmic protein  73.15 
 
 
108 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000392621  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2346  hypothetical protein  72.22 
 
 
108 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000082368  hitchhiker  0.00160333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2233  hypothetical protein  72.22 
 
 
108 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0210467  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2169  putative cytoplasmic protein  71.3 
 
 
108 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000813161  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2434  hypothetical protein  70.37 
 
 
108 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1663  hypothetical protein  55.05 
 
 
170 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1659  hypothetical protein  55.96 
 
 
110 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1723  hypothetical protein  55.36 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.034486  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2748  hypothetical protein  44.95 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1616  hypothetical protein  53.73 
 
 
71 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.396977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1790  hypothetical protein  56.45 
 
 
62 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0940  protein of unknown function DUF1493  33.7 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.255022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0239  protein of unknown function DUF1493  40.3 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2476  hypothetical protein  27.35 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4587  hypothetical protein  33.73 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5116  hypothetical protein  26.79 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221736  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4583  hypothetical protein  26.79 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0109  hypothetical protein  28 
 
 
141 aa  40.8  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>