11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2848 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2848  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  295  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0109  hypothetical protein  47.52 
 
 
141 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4587  hypothetical protein  48.68 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0667  hypothetical protein  32.77 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297183  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0835  hypothetical protein  37.23 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0666  hypothetical protein  38.75 
 
 
124 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131147  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5682  hypothetical protein  34.44 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0152  hypothetical protein  30.23 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1659  hypothetical protein  33.02 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1723  hypothetical protein  31.13 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.034486  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1663  hypothetical protein  31.25 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>