12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0109 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0109  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  289  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2848  hypothetical protein  47.52 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4587  hypothetical protein  38.1 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0835  hypothetical protein  35.11 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0667  hypothetical protein  33.06 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0666  hypothetical protein  38.37 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131147  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5682  hypothetical protein  32.61 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0031  hypothetical protein  33.67 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.040629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1659  hypothetical protein  29.7 
 
 		 110 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1723  hypothetical protein  27.72 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.034486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2336  hypothetical protein  28 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>