14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5116 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4583  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  225  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5116  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  224  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2625  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.050449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1663  hypothetical protein  34.23 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1723  hypothetical protein  32.73 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.034486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0666  hypothetical protein  32.41 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131147  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1659  hypothetical protein  30.91 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2748  hypothetical protein  34.51 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2233  hypothetical protein  27.83 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0210467  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2346  hypothetical protein  27.83 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000082368  hitchhiker  0.00160333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2114  putative cytoplasmic protein  27.83 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000392621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2336  hypothetical protein  26.79 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2434  hypothetical protein  27.78 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2169  putative cytoplasmic protein  26.96 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000813161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>