27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2632 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2632  competence damage-inducible protein A  100 
 
 		 58 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2528  competence damage-inducible protein A  100 
 
 		 58 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.689848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2637  competence damage-inducible protein A  92.98 
 
 		 398 aa  115  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.960732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2429  competence damage-inducible protein A  92.98 
 
 		 398 aa  115  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2516  competence damage-inducible protein A  94.83 
 
 		 58 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.888265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2424  hypothetical protein  93.1 
 
 		 58 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2478  competence damage-inducible protein A  91.23 
 
 		 398 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2521  competence damage-inducible protein A  91.23 
 
 		 398 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2533  competence damage-inducible protein A  91.23 
 
 		 398 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  83.93 
 
 		 400 aa  107  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1409  competence/damage-inducible protein CinA  83.93 
 
 		 400 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02134  hypothetical protein  83.93 
 
 		 400 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1400  competence damage-inducible protein A  83.93 
 
 		 400 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.105485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  83.93 
 
 		 400 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02175  competence damage-inducible protein A  83.93 
 
 		 400 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.478286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  83.93 
 
 		 400 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2473  competence damage-inducible protein A  100 
 
 		 49 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  80.36 
 
 		 400 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2808  competence damage-inducible protein A  69.09 
 
 		 399 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1119  competence damage-inducible protein A  50.91 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3196  competence damage-inducible protein A  49.09 
 
 		 397 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2852  competence damage-inducible protein A  47.27 
 
 		 397 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.309033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1317  competence damage-inducible protein A  47.27 
 
 		 397 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2773  competence damage-inducible protein A  45.45 
 
 		 397 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1051  competence damage-inducible protein A  49.09 
 
 		 397 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3008  competence damage-inducible protein A  47.27 
 
 		 397 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3275  competence damage-inducible protein A  45.28 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>