24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3216 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3216  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000833227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3553  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0586  hypothetical protein  49.55 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0585  hypothetical protein  48.65 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.182991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3445  hypothetical protein  48.65 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0584  hypothetical protein  48.65 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3723  hypothetical protein  49.54 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0545  hypothetical protein  49.54 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4184  hypothetical protein  46.3 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3906  hypothetical protein  49.54 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3780  hypothetical protein  49.54 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3293  hypothetical protein  45.95 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0784  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1273  membrane protein  47.17 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0808  hypothetical protein  46.08 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3038  hypothetical protein  42.59 
 
 		 110 aa  92.8  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0054  hypothetical protein  35.45 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1777  hypothetical protein  34.31 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297893  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0514  hypothetical protein  33.64 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.95823e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4164  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0484  hypothetical protein  35.85 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05030  hypothetical protein  35.85 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3959  hypothetical protein  32 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00427  hypothetical protein  31.73 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>