26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3723 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3723  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  220  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3906  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  220  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3780  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  220  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0545  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  220  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0584  hypothetical protein  94.5 
 
 
111 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0585  hypothetical protein  94.5 
 
 
111 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.182991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3445  hypothetical protein  94.5 
 
 
111 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3293  hypothetical protein  91.74 
 
 
111 aa  206  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0586  hypothetical protein  90.83 
 
 
111 aa  204  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4184  hypothetical protein  47.71 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3553  hypothetical protein  48.62 
 
 
114 aa  124  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3216  hypothetical protein  49.54 
 
 
111 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000833227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0784  hypothetical protein  49.54 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0808  hypothetical protein  45.79 
 
 
122 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1273  membrane protein  39.45 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3038  hypothetical protein  42.2 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47742  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0054  hypothetical protein  29.36 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1777  hypothetical protein  30 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4164  hypothetical protein  34.58 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432807  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0514  hypothetical protein  25.93 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.95823e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0484  hypothetical protein  30.84 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05030  hypothetical protein  30.84 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00427  hypothetical protein  25.74 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0470  hypothetical protein  28.04 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3959  hypothetical protein  30 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5053  hypothetical protein  28.04 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>