26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0586 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0586  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  222  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0585  hypothetical protein  91.89 
 
 		 111 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.182991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3445  hypothetical protein  91.89 
 
 		 111 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0584  hypothetical protein  91.89 
 
 		 111 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3723  hypothetical protein  90.83 
 
 		 110 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3906  hypothetical protein  90.83 
 
 		 110 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3780  hypothetical protein  90.83 
 
 		 110 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0545  hypothetical protein  90.83 
 
 		 110 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3293  hypothetical protein  87.39 
 
 		 111 aa  202  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3553  hypothetical protein  47.22 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3216  hypothetical protein  49.55 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000833227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4184  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0784  hypothetical protein  49.07 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0808  hypothetical protein  43.93 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1273  membrane protein  39.62 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3038  hypothetical protein  39.81 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0054  hypothetical protein  32.58 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0514  hypothetical protein  28.71 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.95823e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1777  hypothetical protein  31.87 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4164  hypothetical protein  33.96 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0484  hypothetical protein  30.19 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05030  hypothetical protein  30.19 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00427  hypothetical protein  24.75 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3959  hypothetical protein  30 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0470  hypothetical protein  26.44 
 
 		 107 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5053  hypothetical protein  26.44 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>