31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0484 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0484  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  213  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05030  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  213  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4164  hypothetical protein  81.31 
 
 
107 aa  178  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432807  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5053  hypothetical protein  56.07 
 
 
107 aa  121  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0470  hypothetical protein  56.07 
 
 
107 aa  121  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5328  hypothetical protein  55.66 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0363  hypothetical protein  53.93 
 
 
108 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669807  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5102  hypothetical protein  52.81 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5152  hypothetical protein  52.81 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.456332  normal  0.766946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4975  hypothetical protein  52.81 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0514  hypothetical protein  42.06 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.95823e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0054  hypothetical protein  39.25 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1777  hypothetical protein  41.89 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3038  hypothetical protein  40.2 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47742  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3216  hypothetical protein  35.85 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000833227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0808  hypothetical protein  36.67 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3553  hypothetical protein  35.96 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3959  hypothetical protein  32.38 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00427  hypothetical protein  32.67 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0784  hypothetical protein  36.59 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4184  hypothetical protein  35.96 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0545  hypothetical protein  30.84 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3723  hypothetical protein  30.84 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3780  hypothetical protein  30.84 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3906  hypothetical protein  30.84 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0586  hypothetical protein  30.19 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1273  membrane protein  31.78 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3293  hypothetical protein  28.71 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0584  hypothetical protein  27.36 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3445  hypothetical protein  27.36 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0585  hypothetical protein  27.36 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.182991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>