31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4164 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4164  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  208  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0484  hypothetical protein  81.31 
 
 		 107 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05030  hypothetical protein  81.31 
 
 		 107 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0470  hypothetical protein  50.47 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5053  hypothetical protein  50.47 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5328  hypothetical protein  50.47 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0363  hypothetical protein  50.57 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5102  hypothetical protein  49.43 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4975  hypothetical protein  49.43 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5152  hypothetical protein  49.43 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.456332  normal  0.766946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0514  hypothetical protein  42.06 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.95823e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0054  hypothetical protein  40.19 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0808  hypothetical protein  42.22 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3038  hypothetical protein  42.7 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1777  hypothetical protein  30.19 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3553  hypothetical protein  38.32 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3216  hypothetical protein  36.79 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000833227  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00427  hypothetical protein  34.31 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3959  hypothetical protein  29.81 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0545  hypothetical protein  34.58 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3723  hypothetical protein  34.58 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3780  hypothetical protein  34.58 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3906  hypothetical protein  34.58 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0586  hypothetical protein  33.96 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0784  hypothetical protein  38.74 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4184  hypothetical protein  39.33 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3293  hypothetical protein  31.13 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0584  hypothetical protein  32.08 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3445  hypothetical protein  32.08 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1273  membrane protein  32.71 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0585  hypothetical protein  32.08 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.182991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>