24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1273 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1273  membrane protein  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0808  hypothetical protein  51.4 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3553  hypothetical protein  46.36 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4184  hypothetical protein  48.18 
 
 		 110 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3216  hypothetical protein  47.17 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000833227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3038  hypothetical protein  42.73 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0784  hypothetical protein  46.36 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0545  hypothetical protein  39.45 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3906  hypothetical protein  39.45 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3780  hypothetical protein  39.45 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0586  hypothetical protein  39.62 
 
 		 111 aa  95.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3293  hypothetical protein  42.42 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3723  hypothetical protein  39.45 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0584  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3445  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0585  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.182991 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0054  hypothetical protein  35.45 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1777  hypothetical protein  33.66 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3959  hypothetical protein  34 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00427  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4164  hypothetical protein  32.71 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0514  hypothetical protein  30 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.95823e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0484  hypothetical protein  31.78 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05030  hypothetical protein  31.78 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>