20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1615 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1615  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  313  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132758  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  36.43 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  30.67 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0054  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  normal  0.044221 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00011  hypothetical protein  28.93 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3780  hypothetical protein  27.01 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19350  hypothetical protein  32.67 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.545788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  31.21 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  30.5 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  31.21 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  31.65 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3625  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.638211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1415  hypothetical protein  33.01 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0097  hypothetical protein  30.66 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2403  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0091  hypothetical protein  31.43 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156914  hitchhiker  0.000348756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3912  hypothetical protein  29.5 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001912  hypothetical protein  25.69 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0642  hypothetical protein  26.03 
 
 		 152 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  25.23 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>