28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3625 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3625  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.638211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  60 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  62.58 
 
 		 155 aa  180  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3912  hypothetical protein  58.06 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  56.77 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  56.77 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  56.13 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4295  hypothetical protein  61.27 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.617343  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4492  hypothetical protein  61.27 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4350  hypothetical protein  61.27 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.488502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0048  hypothetical protein  60.56 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  57.42 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0054  hypothetical protein  52.9 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  normal  0.044221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0097  hypothetical protein  47.1 
 
 		 155 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0091  hypothetical protein  53.9 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156914  hitchhiker  0.000348756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3719  hypothetical protein  67.39 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0232  hypothetical protein  35.95 
 
 		 163 aa  84  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001912  hypothetical protein  34.59 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4824  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2403  hypothetical protein  31.51 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0471  hypothetical protein  36.43 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0208  hypothetical protein  36.94 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00011  hypothetical protein  33.57 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00580  hypothetical protein  32.62 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0011  hypothetical protein  29.61 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1615  hypothetical protein  36.43 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132758  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  31.06 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19350  hypothetical protein  33.68 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.545788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>