28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4729 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  313  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  91.61 
 
 		 155 aa  254  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  91.61 
 
 		 155 aa  254  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  90.97 
 
 		 155 aa  254  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3912  hypothetical protein  87.1 
 
 		 155 aa  244  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4295  hypothetical protein  80.65 
 
 		 155 aa  220  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.617343  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4492  hypothetical protein  80.65 
 
 		 155 aa  220  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4350  hypothetical protein  80.65 
 
 		 155 aa  220  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.488502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0048  hypothetical protein  80 
 
 		 155 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  57.42 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  61.29 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0054  hypothetical protein  54.19 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  normal  0.044221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0097  hypothetical protein  51.61 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0091  hypothetical protein  57.24 
 
 		 159 aa  157  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156914  hitchhiker  0.000348756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3625  hypothetical protein  59.84 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.638211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3719  hypothetical protein  55.56 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001912  hypothetical protein  34.25 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0232  hypothetical protein  35.25 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00011  hypothetical protein  34.64 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2403  hypothetical protein  32.85 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0471  hypothetical protein  37.88 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00580  hypothetical protein  32.82 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4824  hypothetical protein  34.29 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0208  hypothetical protein  30.97 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0011  hypothetical protein  29.87 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  31.21 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1615  hypothetical protein  31.65 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132758  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0642  hypothetical protein  27.08 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>