16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1415 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1415  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  306  6.999999999999999e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19350  hypothetical protein  60.32 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.545788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  33.06 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3780  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0642  hypothetical protein  28.06 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0471  hypothetical protein  31.43 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  33.96 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0011  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  31.01 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  31.01 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  31.01 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  29.32 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0232  hypothetical protein  30.23 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0097  hypothetical protein  25.36 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  28.12 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1615  hypothetical protein  32.43 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132758  normal  0.639267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>