23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2558 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1906  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186057  normal  0.142131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2558  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281489  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2438  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0552178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2445  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2200  hypothetical protein  90.14 
 
 
77 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2598  hypothetical protein  88.73 
 
 
71 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1780  hypothetical protein  84.51 
 
 
72 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0375803  normal  0.0296624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1675  hypothetical protein  83.1 
 
 
72 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116343  normal  0.567132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1750  hypothetical protein  83.1 
 
 
72 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2226  hypothetical protein  59.15 
 
 
72 aa  92.8  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0399077  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1804  hypothetical protein  56.34 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00318058  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2481  hypothetical protein  53.52 
 
 
71 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00238478  hitchhiker  0.00335305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1937  hypothetical protein  53.73 
 
 
76 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2135  hypothetical protein  53.52 
 
 
74 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141239  normal  0.38352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1724  hypothetical protein  56.34 
 
 
71 aa  82  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000355641  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1587  hypothetical protein  47.89 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00606067  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1547  hypothetical protein  39.71 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003434  hypothetical protein  40 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.880664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1101  hypothetical protein  36.92 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2807  hypothetical protein  42.25 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.244352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1055  hypothetical protein  28.57 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.231807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1997  hypothetical protein  30.43 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669002  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2958  hypothetical protein  36.76 
 
 
72 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>