29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1997 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1997  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669002  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02006  hypothetical protein  40.58 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000861224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2086  hypothetical protein  38.36 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24630  hypothetical protein  38.36 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1547  hypothetical protein  35.29 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2598  hypothetical protein  36.23 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3012  hypothetical protein  34.72 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320414  decreased coverage  0.00000000000000430073 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003434  hypothetical protein  40.28 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.880664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1101  hypothetical protein  38.57 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1780  hypothetical protein  35.71 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0375803  normal  0.0296624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1750  hypothetical protein  35.71 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1675  hypothetical protein  35.71 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116343  normal  0.567132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1737  hypothetical protein  30.56 
 
 		 73 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2200  hypothetical protein  29.17 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2438  hypothetical protein  30.43 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0552178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1906  hypothetical protein  30.43 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186057  normal  0.142131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1984  hypothetical protein  36.23 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2558  hypothetical protein  30.43 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281489  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2481  hypothetical protein  28.57 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00238478  hitchhiker  0.00335305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2226  hypothetical protein  31.94 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0399077  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2445  hypothetical protein  30.43 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1055  hypothetical protein  29.17 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.231807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1804  hypothetical protein  31.94 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00318058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1131  hypothetical protein  30.56 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1749  hypothetical protein  26.15 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2135  hypothetical protein  26.09 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141239  normal  0.38352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1937  hypothetical protein  28.17 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2958  hypothetical protein  31.94 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1724  hypothetical protein  27.54 
 
 		 71 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000355641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>