25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1055 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1055  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.231807  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1749  hypothetical protein  47.14 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1131  hypothetical protein  36.11 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2958  hypothetical protein  41.67 
 
 
72 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2086  hypothetical protein  38.89 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24630  hypothetical protein  38.89 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1675  hypothetical protein  32.86 
 
 
72 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116343  normal  0.567132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1750  hypothetical protein  32.86 
 
 
72 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1780  hypothetical protein  32.86 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0375803  normal  0.0296624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2598  hypothetical protein  31.43 
 
 
71 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3012  hypothetical protein  31.94 
 
 
73 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320414  decreased coverage  0.00000000000000430073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1737  hypothetical protein  26.39 
 
 
73 aa  50.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1984  hypothetical protein  40.91 
 
 
78 aa  50.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2200  hypothetical protein  30.56 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2445  hypothetical protein  28.57 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2438  hypothetical protein  28.57 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0552178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2558  hypothetical protein  28.57 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281489  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1906  hypothetical protein  28.57 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186057  normal  0.142131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1997  hypothetical protein  29.17 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669002  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2476  hypothetical protein  36.11 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1101  hypothetical protein  31.94 
 
 
78 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2226  hypothetical protein  22.22 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0399077  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1804  hypothetical protein  29.23 
 
 
84 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00318058  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02006  hypothetical protein  38.18 
 
 
80 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000861224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003434  hypothetical protein  27.78 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.880664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>