21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1937 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1937  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  158  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1804  hypothetical protein  58.57 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00318058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2200  hypothetical protein  56.52 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1906  hypothetical protein  53.73 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186057  normal  0.142131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2445  hypothetical protein  53.73 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2558  hypothetical protein  53.73 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281489  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2438  hypothetical protein  53.73 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0552178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2135  hypothetical protein  52.86 
 
 		 74 aa  84.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141239  normal  0.38352 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1780  hypothetical protein  53.73 
 
 		 72 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0375803  normal  0.0296624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1675  hypothetical protein  53.73 
 
 		 72 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116343  normal  0.567132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1750  hypothetical protein  53.73 
 
 		 72 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2598  hypothetical protein  52.24 
 
 		 71 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1587  hypothetical protein  52.24 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00606067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2481  hypothetical protein  50.72 
 
 		 71 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00238478  hitchhiker  0.00335305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1724  hypothetical protein  50.72 
 
 		 71 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000355641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2226  hypothetical protein  49.28 
 
 		 72 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0399077  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003434  hypothetical protein  45.31 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.880664  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1547  hypothetical protein  35.82 
 
 		 74 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1101  hypothetical protein  39.06 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2958  hypothetical protein  35.71 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1997  hypothetical protein  28.17 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>