27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1804 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1804  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  175  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00318058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1937  hypothetical protein  58.57 
 
 		 76 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2135  hypothetical protein  54.17 
 
 		 74 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141239  normal  0.38352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2200  hypothetical protein  53.09 
 
 		 77 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1906  hypothetical protein  56.34 
 
 		 71 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186057  normal  0.142131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2558  hypothetical protein  56.34 
 
 		 71 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281489  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2438  hypothetical protein  56.34 
 
 		 71 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0552178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2445  hypothetical protein  56.34 
 
 		 71 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2481  hypothetical protein  53.52 
 
 		 71 aa  89.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00238478  hitchhiker  0.00335305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1675  hypothetical protein  54.93 
 
 		 72 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116343  normal  0.567132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1750  hypothetical protein  54.93 
 
 		 72 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1780  hypothetical protein  54.93 
 
 		 72 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0375803  normal  0.0296624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2598  hypothetical protein  54.93 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1587  hypothetical protein  46.15 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00606067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1724  hypothetical protein  47.89 
 
 		 71 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000355641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2226  hypothetical protein  47.22 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0399077  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1547  hypothetical protein  41.79 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003434  hypothetical protein  39.13 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.880664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1101  hypothetical protein  34.78 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2958  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1997  hypothetical protein  31.94 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3012  hypothetical protein  30.43 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320414  decreased coverage  0.00000000000000430073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2086  hypothetical protein  26.15 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24630  hypothetical protein  26.15 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2807  hypothetical protein  35.21 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.244352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1055  hypothetical protein  29.23 
 
 		 72 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.231807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1131  hypothetical protein  27.69 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.194615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>