23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4819 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3736  permease YjgP/YjgQ family protein  98.7 
 
 		 1080 bp  2022    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00233017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  98.82 
 
 		 1101 bp  2072    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000267736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  98.91 
 
 		 1101 bp  2079    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000294674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  85.23 
 
 		 1101 bp  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  85.32 
 
 		 1101 bp  890    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  85.14 
 
 		 1101 bp  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  85.41 
 
 		 1101 bp  898    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  85.23 
 
 		 1101 bp  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4819    100 
 
 		 1100 bp  2181    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  98.55 
 
 		 1101 bp  2048    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000002134  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  98.91 
 
 		 1101 bp  2079    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  99 
 
 		 1101 bp  2087    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  98.64 
 
 		 1101 bp  2056    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  98.82 
 
 		 1101 bp  2072    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000245131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  80.23 
 
 		 1101 bp  365  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0563  permease YjgP/YjgQ family protein  80 
 
 		 1095 bp  109  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000298554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3556  permease YjgP/YjgQ family protein  78.55 
 
 		 1101 bp  77.8  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  83.18 
 
 		 1095 bp  69.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  83.18 
 
 		 1095 bp  69.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  83.18 
 
 		 1095 bp  69.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  80.88 
 
 		 1116 bp  63.9  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3719  permease YjgP/YjgQ family protein  82.24 
 
 		 1113 bp  61.9  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  85.71 
 
 		 1113 bp  60  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>