81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4343 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4343    100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.870413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4388    100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0191857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4093  hypothetical protein  100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.198281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4252  hypothetical protein  99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.119945  normal  0.106778 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4387  hypothetical protein  100 
 
 		 105 bp  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0318725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0933  hypothetical protein  94.29 
 
 		 189 bp  107  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3693  hypothetical protein  98.11 
 
 		 129 bp  97.6  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0963  hypothetical protein  91.67 
 
 		 213 bp  95.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4094  hypothetical protein  92.65 
 
 		 183 bp  95.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3579  hypothetical protein  100 
 
 		 246 bp  93.7  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.76094  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4739  hypothetical protein  100 
 
 		 138 bp  89.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.662554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4423  hypothetical protein  100 
 
 		 138 bp  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3375  hypothetical protein  96.23 
 
 		 141 bp  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000276807  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0602    100 
 
 		 120 bp  87.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3987  hypothetical protein  91.18 
 
 		 228 bp  87.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3311  hypothetical protein  94.64 
 
 		 153 bp  87.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.930689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4460  hypothetical protein  96.08 
 
 		 150 bp  85.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4171  hypothetical protein  96.08 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4476  hypothetical protein  96.08 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.540119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0006  hypothetical protein  100 
 
 		 411 bp  85.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0005    100 
 
 		 411 bp  85.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.820621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3252  hypothetical protein  100 
 
 		 177 bp  83.8  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0131  enterobactin synthetase component D  97.83 
 
 		 138 bp  83.8  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0774  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  100 
 
 		 195 bp  83.8  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0852  hypothetical protein  97.67 
 
 		 162 bp  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4567  hypothetical protein  97.67 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0736  hypothetical protein  100 
 
 		 174 bp  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0863  hypothetical protein  97.67 
 
 		 162 bp  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0542  hypothetical protein  97.62 
 
 		 150 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5371  hypothetical protein  89.39 
 
 		 183 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0501  hypothetical protein  97.62 
 
 		 150 bp  75.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.263558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4790  hypothetical protein  100 
 
 		 195 bp  73.8  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4922  hypothetical protein  100 
 
 		 195 bp  73.8  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4551  hypothetical protein  100 
 
 		 195 bp  73.8  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0386  hypothetical protein  100 
 
 		 297 bp  73.8  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4450  hypothetical protein  97.5 
 
 		 144 bp  71.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0387  hypothetical protein  100 
 
 		 186 bp  69.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.545968 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3301  hypothetical protein  100 
 
 		 297 bp  69.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.474797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00281  hypothetical protein  100 
 
 		 297 bp  69.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3284  hypothetical protein  100 
 
 		 297 bp  69.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4788  hypothetical protein  90.57 
 
 		 138 bp  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2957  hypothetical protein  100 
 
 		 111 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0449523  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2518  hypothetical protein  97.22 
 
 		 96 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000103038  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0561  hypothetical protein  97.22 
 
 		 231 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1020  hypothetical protein  97.22 
 
 		 138 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.415915 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4624  hypothetical protein  97.22 
 
 		 129 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0562  hypothetical protein  97.22 
 
 		 267 bp  63.9  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0653    90.2 
 
 		 228 bp  61.9  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0759    90.2 
 
 		 228 bp  61.9  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.249966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0783  hypothetical protein  90.2 
 
 		 228 bp  61.9  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000747563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1042  hypothetical protein  91.49 
 
 		 129 bp  61.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.138752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3576  hypothetical protein  97.06 
 
 		 96 bp  60  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3291  hypothetical protein  97.06 
 
 		 96 bp  60  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0756  hypothetical protein  96.88 
 
 		 120 bp  56  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3434    94.29 
 
 		 198 bp  54  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4208  hypothetical protein  100 
 
 		 102 bp  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3044  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 744 bp  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144364  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1966  hypothetical protein  100 
 
 		 147 bp  52  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3911  hypothetical protein  100 
 
 		 102 bp  52  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.954869  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4296  hypothetical protein  93.94 
 
 		 156 bp  50.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2104  hypothetical protein  100 
 
 		 147 bp  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3280  hypothetical protein  100 
 
 		 120 bp  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637704 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1937  hypothetical protein  96.55 
 
 		 126 bp  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0799616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1503  hypothetical protein  96.55 
 
 		 126 bp  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4831  hypothetical protein  93.94 
 
 		 234 bp  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00480707  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1560  hypothetical protein  100 
 
 		 153 bp  50.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4534  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfF  94.59 
 
 		 510 bp  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4496  hypothetical protein  94.59 
 
 		 150 bp  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560368  normal  0.146153 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4625  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfF  94.59 
 
 		 510 bp  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.773525  normal  0.804326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0534  hypothetical protein  94.44 
 
 		 141 bp  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4642  hypothetical protein  96.43 
 
 		 132 bp  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.943406  normal  0.202422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0594  hypothetical protein  94.44 
 
 		 141 bp  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1139  hypothetical protein  96.43 
 
 		 198 bp  48.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.51258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4591  hypothetical protein  96.43 
 
 		 132 bp  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1261  hypothetical protein  96.43 
 
 		 120 bp  48.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.129609  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0540  hypothetical protein  94.44 
 
 		 141 bp  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0723198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3226    94.29 
 
 		 183 bp  46.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.012048  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3303  hypothetical protein  94.29 
 
 		 207 bp  46.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2630  hypothetical protein  96.15 
 
 		 111 bp  44.1  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.397048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2778  hypothetical protein  96.15 
 
 		 111 bp  44.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00219494  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0535  hypothetical protein  94.12 
 
 		 141 bp  44.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>