29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0759 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0783  hypothetical protein  100 
 
 
228 bp  452  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000747563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0759    100 
 
 
228 bp  452  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.249966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0653    99.56 
 
 
228 bp  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3693  hypothetical protein  88.71 
 
 
129 bp  127  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3311  hypothetical protein  86.78 
 
 
153 bp  105  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.930689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4739  hypothetical protein  89.53 
 
 
138 bp  99.6  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.662554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4423  hypothetical protein  89.53 
 
 
138 bp  99.6  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0774  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  87.62 
 
 
195 bp  97.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538711  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4460  hypothetical protein  85.59 
 
 
150 bp  91.7  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610094  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3987  hypothetical protein  87.1 
 
 
228 bp  89.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0852  hypothetical protein  85.84 
 
 
162 bp  89.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0863  hypothetical protein  85.84 
 
 
162 bp  89.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0963  hypothetical protein  82.28 
 
 
213 bp  83.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3375  hypothetical protein  87.84 
 
 
141 bp  75.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000276807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0006  hypothetical protein  89.23 
 
 
411 bp  73.8  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0005    89.23 
 
 
411 bp  73.8  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.820621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0933  hypothetical protein  85.71 
 
 
189 bp  71.9  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3252  hypothetical protein  88 
 
 
177 bp  69.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4388    90.2 
 
 
114 bp  61.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0191857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4093  hypothetical protein  90.2 
 
 
114 bp  61.9  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.198281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4343    90.2 
 
 
114 bp  61.9  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.870413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4094  hypothetical protein  86.57 
 
 
183 bp  61.9  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3579  hypothetical protein  90 
 
 
246 bp  60  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.76094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4252  hypothetical protein  88.24 
 
 
114 bp  54  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.119945  normal  0.106778 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0736  hypothetical protein  85.48 
 
 
174 bp  52  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0602    85.51 
 
 
120 bp  50.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0552  hypothetical protein  87.5 
 
 
141 bp  48.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0588  hypothetical protein  87.5 
 
 
141 bp  48.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0131  enterobactin synthetase component D  86.27 
 
 
138 bp  46.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168816  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>