24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4788 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4788  hypothetical protein  100 
 
 
45 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3375  hypothetical protein  76.19 
 
 
46 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000276807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0736  hypothetical protein  71.11 
 
 
57 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4460  hypothetical protein  75 
 
 
49 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0542  hypothetical protein  66.67 
 
 
49 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3693  hypothetical protein  71.43 
 
 
42 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0501  hypothetical protein  64.44 
 
 
49 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.263558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3311  hypothetical protein  66.67 
 
 
50 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.930689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0963  hypothetical protein  71.43 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4739  hypothetical protein  71.05 
 
 
45 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.662554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4423  hypothetical protein  71.05 
 
 
45 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4094  hypothetical protein  69.05 
 
 
60 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0774  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  76.47 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538711  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0933  hypothetical protein  65.12 
 
 
62 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4450  hypothetical protein  64.44 
 
 
47 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1966  hypothetical protein  75.76 
 
 
48 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2104  hypothetical protein  75.76 
 
 
48 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0131  enterobactin synthetase component D  60 
 
 
45 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168816  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3911  hypothetical protein  62.5 
 
 
33 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.954869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4208  hypothetical protein  62.5 
 
 
33 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0006  hypothetical protein  67.74 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0783  hypothetical protein  70.37 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000747563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0552  hypothetical protein  75 
 
 
46 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0588  hypothetical protein  75 
 
 
46 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>