22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0501 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0501  hypothetical protein  100 
 
 
49 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.263558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0542  hypothetical protein  97.96 
 
 
49 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3311  hypothetical protein  71.11 
 
 
50 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.930689  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4094  hypothetical protein  71.11 
 
 
60 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3375  hypothetical protein  73.81 
 
 
46 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000276807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3693  hypothetical protein  73.81 
 
 
42 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4788  hypothetical protein  64.44 
 
 
45 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0736  hypothetical protein  68.89 
 
 
57 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0131  enterobactin synthetase component D  68.89 
 
 
45 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168816  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0963  hypothetical protein  64.44 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4460  hypothetical protein  68.29 
 
 
49 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4423  hypothetical protein  71.05 
 
 
45 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0933  hypothetical protein  60 
 
 
62 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4739  hypothetical protein  71.05 
 
 
45 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.662554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0774  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  73.53 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538711  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4450  hypothetical protein  57.45 
 
 
47 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1966  hypothetical protein  63.89 
 
 
48 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2104  hypothetical protein  63.89 
 
 
48 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0006  hypothetical protein  57.78 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4208  hypothetical protein  65.52 
 
 
33 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3911  hypothetical protein  65.52 
 
 
33 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.954869  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0387  hypothetical protein  62.16 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.545968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>