64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3434 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3434    100 
 
 
198 bp  392  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0562  hypothetical protein  85.4 
 
 
267 bp  103  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0561  hypothetical protein  83.21 
 
 
231 bp  79.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2518  hypothetical protein  97.22 
 
 
96 bp  63.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000103038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4624  hypothetical protein  97.14 
 
 
129 bp  61.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0852  hypothetical protein  97.14 
 
 
162 bp  61.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0963  hypothetical protein  97.14 
 
 
213 bp  61.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0863  hypothetical protein  97.14 
 
 
162 bp  61.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4831  hypothetical protein  85.37 
 
 
234 bp  60  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00480707  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4491  hypothetical protein  97.37 
 
 
99 bp  60  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2348  hypothetical protein  94.59 
 
 
216 bp  58  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00281  hypothetical protein  94.44 
 
 
297 bp  56  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0408  hypothetical protein  83.91 
 
 
141 bp  56  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0387  hypothetical protein  94.44 
 
 
186 bp  56  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.545968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0386  hypothetical protein  94.44 
 
 
297 bp  56  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3301  hypothetical protein  94.44 
 
 
297 bp  56  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.474797  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3284  hypothetical protein  94.44 
 
 
297 bp  56  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3375  hypothetical protein  94.29 
 
 
141 bp  54  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000276807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4790  hypothetical protein  94.29 
 
 
195 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4343    94.29 
 
 
114 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.870413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3987  hypothetical protein  94.29 
 
 
228 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0005    94.29 
 
 
411 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.820621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0006  hypothetical protein  94.29 
 
 
411 bp  54  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4922  hypothetical protein  94.29 
 
 
195 bp  54  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4739  hypothetical protein  94.29 
 
 
138 bp  54  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.662554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0736  hypothetical protein  94.29 
 
 
174 bp  54  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4476  hypothetical protein  94.29 
 
 
117 bp  54  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.540119  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4388    94.29 
 
 
114 bp  54  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0191857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3252  hypothetical protein  94.29 
 
 
177 bp  54  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4094  hypothetical protein  94.29 
 
 
183 bp  54  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3274  hypothetical protein  81.29 
 
 
447 bp  54  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0602    94.29 
 
 
120 bp  54  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0774  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  94.29 
 
 
195 bp  54  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538711  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3579  hypothetical protein  94.29 
 
 
246 bp  54  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.76094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3693  hypothetical protein  94.29 
 
 
129 bp  54  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4093  hypothetical protein  94.29 
 
 
114 bp  54  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.198281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0102  hypothetical protein  94.74 
 
 
114 bp  54  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4171  hypothetical protein  94.29 
 
 
117 bp  54  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4423  hypothetical protein  94.29 
 
 
138 bp  54  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4551  hypothetical protein  94.29 
 
 
195 bp  54  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4460  hypothetical protein  94.29 
 
 
150 bp  54  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610094  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0167  hypothetical protein  94.74 
 
 
267 bp  52  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4808  hypothetical protein  94.74 
 
 
105 bp  52  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2816  hypothetical protein  92.86 
 
 
180 bp  52  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2963  hypothetical protein  92.86 
 
 
111 bp  52  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2962  hypothetical protein  92.86 
 
 
165 bp  52  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4567  hypothetical protein  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4252  hypothetical protein  96.55 
 
 
114 bp  50.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.119945  normal  0.106778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  100 
 
 
2058 bp  48.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4625  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfF  94.44 
 
 
510 bp  48.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.773525  normal  0.804326 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4534  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfF  94.44 
 
 
510 bp  48.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0131  enterobactin synthetase component D  96.43 
 
 
138 bp  48.1  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168816  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3311  hypothetical protein  96.43 
 
 
153 bp  48.1  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.930689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0542  hypothetical protein  91.67 
 
 
150 bp  48.1  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2961  hypothetical protein  92.5 
 
 
96 bp  48.1  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2778  hypothetical protein  91.67 
 
 
111 bp  48.1  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00219494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2630  hypothetical protein  91.67 
 
 
111 bp  48.1  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.397048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0501  hypothetical protein  91.67 
 
 
150 bp  48.1  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.263558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4450  hypothetical protein  91.43 
 
 
144 bp  46.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3576  hypothetical protein  96.3 
 
 
96 bp  46.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0933  hypothetical protein  91.43 
 
 
189 bp  46.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1020  hypothetical protein  91.43 
 
 
138 bp  46.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.415915 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5371  hypothetical protein  91.43 
 
 
183 bp  46.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3291  hypothetical protein  96.3 
 
 
96 bp  46.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>