7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3301 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3284  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  187  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3301  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  187  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.474797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00281  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  187  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0386  hypothetical protein  90.82 
 
 		 98 aa  170  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0387  hypothetical protein  92.68 
 
 		 61 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.545968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0963  hypothetical protein  45.16 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0736  hypothetical protein  64.86 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>