More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3103 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3103  electron transfer flavoprotein  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000649113  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02615  predicted flavoprotein  99.23 
 
 
259 aa  517  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0918  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  99.23 
 
 
259 aa  517  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  99.23 
 
 
259 aa  517  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02578  hypothetical protein  99.23 
 
 
259 aa  517  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3072  electron transfer flavoprotein  98.84 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.739339  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2910  electron transfer flavoprotein  96.14 
 
 
259 aa  488  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4026  electron transfer flavoprotein  96.53 
 
 
259 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2899  electron transfer flavoprotein  96.14 
 
 
259 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3038  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.77 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  26.53 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.16 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6291  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.33 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1601  electron transfer flavoprotein beta-subunit  26.59 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4259  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.98 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1383  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.37 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0429  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  26.53 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00264268  normal  0.0445881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  27.1 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2099  electron transfer flavoprotein beta-subunit  27.84 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2153  electron transfer flavoprotein subunit beta  26.34 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000153596  normal  0.854717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  26.7 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  28.74 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2519  electron transfer flavoprotein beta-subunit  24.14 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13045  electron transfer flavoprotein beta subunit fixA  29.63 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000726772  hitchhiker  0.00331196 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0984  electron transfer flavoprotein subunit beta  30.83 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0953  electron transfer flavoprotein subunit beta  30.83 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1850  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.49 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1870  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.49 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1916  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.49 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0359178  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  29.24 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1333  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.04 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1469  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  26.79 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0106  electron transfer flavoprotein beta-subunit  27.38 
 
 
266 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0571766  normal  0.27576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  26.63 
 
 
259 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  26.44 
 
 
259 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0440  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.27 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2784  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  25.84 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0655  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.45 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  25.95 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3260  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  27.22 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.68 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2626  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.59 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2855  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.71 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2950  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.88 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  25.49 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  23.53 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2917  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  27.56 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0846128  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3659  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.23 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1480  electron transfer flavoprotein, beta subunit  29.26 
 
 
280 aa  58.9  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.59 
 
 
260 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1196  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.26 
 
 
280 aa  58.9  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  27.4 
 
 
259 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3577  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.38 
 
 
284 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161962  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1691  electron transfer flavoprotein subunit beta  23.57 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0456  electron transfer flavoprotein beta-subunit  24.18 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3169  electron transfer flavoprotein beta-subunit  24.18 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1436  electron transfer flavoprotein subunit beta FixA  27.89 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000812152  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4351  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  25.81 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0324  electron transfer flavoprotein beta-subunit  23.57 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171629  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4635  electron transfer flavoprotein, beta subunit  25.81 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4650  electron transfer flavoprotein, beta subunit  25.81 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4419  electron transfer flavoprotein subunit beta  25.81 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4270  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  25.81 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4760  electron transfer flavoprotein subunit beta  25.81 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  27.56 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4651  electron transfer flavoprotein, beta subunit  25.81 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  25.79 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1074  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.01 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250999  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2550  electron transfer flavoprotein beta-subunit  25.81 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321051  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10278  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07300)  28.8 
 
 
261 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.19095  normal  0.236611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0604  electron transfer flavoprotein, beta subunit  25.81 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.92 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  22.93 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  26.77 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.68 
 
 
249 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000795792  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  26.77 
 
 
249 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0719  electron transfer flavoprotein beta-subunit  25.95 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.02869  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2556  electron transfer flavoprotein beta-subunit  25.79 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629709  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.25 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4631  electron transfer flavoprotein, beta subunit  25.81 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00479771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  26.77 
 
 
249 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2133  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.92 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000214154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3223  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  25.81 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2354  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  26.76 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1047  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  26.87 
 
 
248 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163959  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0395  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  25.93 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200631  hitchhiker  0.00107204 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  27.56 
 
 
249 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.33 
 
 
263 aa  55.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2511  electron transfer flavoprotein beta-subunit  25.98 
 
 
249 aa  55.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  26.46 
 
 
259 aa  55.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2776  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  27.34 
 
 
277 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  25.7 
 
 
259 aa  55.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  25.98 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1998  ATPase  25.98 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00163986  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2427  electron transfer flavoprotein beta-subunit  22.93 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  26.48 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4929  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.42 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02100  mitochondrion protein, putative  23.6 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1240  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  28.67 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854094  normal  0.0273988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0713  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  27.16 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>