72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1978 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1978  N,N'-diacetylchitobiose-specific phosphotransferase enzyme IIAcomponent  100 
 
 		 83 aa  166  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.760622  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1906  PTS system, lactose-specific IIa component  100 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00656424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1957  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  100 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01705  N,N'-diacetylchitobiose-specific enzyme IIA component of PTS  100 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01693  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1455  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  100 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305267 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1896  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  98.78 
 
 		 116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398825  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2454  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  100 
 
 		 115 aa  164  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1428  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  84.15 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.33758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1443  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  84.15 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1411  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  84.15 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.988093  normal  0.0554493 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1857  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  84.15 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.753754  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2030  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  84.15 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1708  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  78.05 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1146  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  68.29 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.180764  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1093  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIA  68.29 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000414863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03623  hypothetical protein  53.03 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002437  PTS system cellobiose-specific IIA component  53.03 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0902  PTS system, cellobiose-specific IIA component  50 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0035  phosphotransferase system PTS, lactose/cellobiose-specific IIA subunit  48.44 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.552409 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1660  PTS system, lactose/cellobiose specific IIA subunit  44.93 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0349238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0199  phosphotransferase system PTS, lactose/cellobiose-specific IIA subunit  44.78 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.410442  normal  0.026204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4590  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  45.21 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1054  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  51.52 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.869022  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0707  phosphotransferase system (PTS) component IIA  49.25 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3470  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  43.21 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.718135  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1822  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  43.75 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.382223  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2106  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  43.75 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.30662  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1635  PTS system lactose/cellobiose-specific family IIA subunit  47.69 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1618  PTS system lactose/cellobiose-specific family IIA subunit  47.69 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1737  PTS system lactose/cellobiose-specific family IIA subunit  47.69 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0735  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  46.97 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5002  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  49.15 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5057  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA  49.15 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4887  PTS system, cellobiose-specific IIA component (phosphotransferase enzyme II, A component)  49.15 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5442  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA  49.15 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5374  PTS system, cellobiose-specific IIA component  49.15 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5319  PTS system, cellobiose-specific IIA component  49.15 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2902  PTS system protein  39.39 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5329  PTS system, cellobiose-specific IIA component  49.15 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4902  PTS system, cellobiose-specific IIA component (phosphotransferase enzyme II, A component)  49.15 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5298  PTS system, cellobiose-specific IIA component  49.15 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000267843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3752  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  47.46 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5630  PTS system, cellobiose-specific IIA component  47.46 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000583884 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0328  PTS system, cellobiose-specific IIA component  43.33 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0213134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4222  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  42.42 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0481716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1856  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  40.91 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0466  cellobiose-specific PTS system IIA component  47.17 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00160406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0755  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  42.42 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0946251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0265  phosphotransferase system PTS, lactose/cellobiose-specific IIA subunit  38.71 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2581  PTS system  37.88 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5625  PTS system, cellobiose-specific IIA component  40.98 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000471892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0011  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  39.06 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5324  PTS system, cellobiose-specific IIA component  40.98 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5303  PTS system, cellobiose-specific IIA component  40.98 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000834521 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5447  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA  40.98 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4907  PTS system, cellobiose-specific IIA component (phosphotransferase enzyme II, A component)  40.98 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4894  PTS system, cellobiose-specific IIA component (phosphotransferase enzyme II, A component)  40.98 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5062  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA  40.98 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0010  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  40.62 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3755  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  40.98 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2137  PTS system, lactose-specific IIa component  38.1 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0535  phosphotransferase system PTS, lactose/cellobiose-specific IIA subunit  32.81 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3347  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose- specific IIA subunit  33.87 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5005  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  37.7 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0339  cellobiose-specific PTS system IIA component  37.93 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0197  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose- specific IIA subunit  39.66 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2918  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  33.33 
 
 		 107 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0882  PTS system, cellobiose-specific IIA component  40 
 
 		 106 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0953  PTS system, cellobiose-specific IIA component  40 
 
 		 106 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0752  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA  40 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0791  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA  40 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>