50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1468 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1468  phage minor tail protein  100 
 
 		 109 aa  227  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1634  phage minor tail protein  91.74 
 
 		 109 aa  206  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.155069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2105  minor tail family protein  88.99 
 
 		 109 aa  203  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000552364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00746  hypothetical protein  88.07 
 
 		 109 aa  201  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10050  tail component  88.07 
 
 		 109 aa  201  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3193  phage minor tail protein  83.49 
 
 		 109 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3125  phage minor tail protein  83.49 
 
 		 109 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0375615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1873  phage minor tail protein  83.49 
 
 		 109 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1797  phage minor tail protein  83.49 
 
 		 109 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0884  phage minor tail protein  83.49 
 
 		 109 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2767  phage minor tail protein  82.57 
 
 		 109 aa  188  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.805166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1196  phage minor tail protein  82.57 
 
 		 109 aa  188  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1417  phage minor tail protein  61.47 
 
 		 110 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0253918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1152  phage minor tail protein  61.47 
 
 		 110 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1080  phage minor tail protein  60.55 
 
 		 110 aa  146  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0909  phage minor tail protein  53.7 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0704  phage minor tail protein  51.85 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2800  phage minor tail protein  51.85 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1089  phage minor tail protein  47.75 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.674881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1199  phage minor tail protein  43.12 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2882  phage minor tail protein  44.55 
 
 		 113 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2236  phage minor tail protein  44.55 
 
 		 113 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000997154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2172  phage minor tail protein  44.55 
 
 		 113 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1550  phage minor tail protein  43.64 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0913332  hitchhiker  0.00355714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1883  phage minor tail  39.42 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2582  minor tail family protein  36.36 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.509278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2952  prophage LambdaSo, minor tail protein M, putative  37.66 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0450  LambdaSo, minor tail protein M  34.09 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1689  Phage minor tail protein  35.87 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2418  phage minor tail protein  34.83 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0502911  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1057  Phage minor tail protein  35.87 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0742722  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3877  minor tail family protein  34.26 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266915  normal  0.28398 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3386  minor tail family protein  32.99 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36986  hitchhiker  0.000000000407319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2779  Phage minor tail  35.9 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00996028  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1691  phage HK97 GP17-like protein  31.71 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.294427  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0090  phage minor tail protein  29.52 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0659  phage minor tail protein  29.73 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000282073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0781  hypothetical protein  30.91 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08250  hypothetical protein  30 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222375 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2224  phage minor tail family protein  31.58 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1637  Phage minor tail protein  34.21 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5471  hypothetical protein  29.46 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3100  minor tail family protein  32.05 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.033574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3932  minor tail family protein  32.05 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5051  minor tail family protein  33.98 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4061  minor tail family protein  34.78 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2201  phage minor tail protein  29.49 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6226  minor tail family protein  28.89 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3531  minor tail family protein  26.67 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7020  minor tail family protein  27.78 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>